Центр коллективного пользования «Прикладная генетика»
Cпециализируется на исследованиях и разработках в области молекулярных технологий
Узнать подробнее
Об институте
Центр коллективного пользования в области генетики (ЦКП «Прикладная генетика») создан 28 сентября 2020 года на основании приказа №48-6а (от 28.09.2020 г.). ЦКП является структурным подразделением Центра внедрения геномных технологий Федерального государственного автономного образовательного учреждения высшего образования «Московский физико-технический институт (национальный исследовательский университет)».
Руководитель ЦКП «Прикладная генетика» – Мелерзанов Александр Викторович, к.м.н.
Исполнительный директор Центра внедрения геномных технологий МФТИ - Гудков Денис Андреевич, к.х.н.
Исследования
Исследование предрасположенностей методом нанопорового секвенирования (лабораторное исследование)
Молекулярные основы жизнеспособности
Система жизнепроектирования и разработки индивидуальных рекомендаций по здоровому образу жизни на основании «omics"-данных индивида
Разработка тест-системы для проведения жидкостной биопсии опухолевого материала с целью контроля терапевтического воздействия
Направления исследований
Биоматериалы и диагностика заболеваний
Индивидуализированная диагностика и анализ рисков
Исследование мутаций в ДНК (наследственных и соматических)
Тест-системы для жидкостной биопсии
Генотипирование (iScan, Solo-тест ABC)
Цифровая и real-time ПЦР (QIAcuity, Rotor-Gene Q)
Иммуноферментный анализ ELISYS Duo
Проверка целостности РНК
Клеточные технологии и культура
Работа с живыми клетками, визуализация и функциональные тесты
Сортировка и исследование пролиферации клеток
xCelligence — мониторинг клеточной активности
Работа с единичными клетками (Chromium Controller)
Клеточный имиджер Celena S
Цитофлуориметрия (BD Accuri TM C6)
Аналитика и секвенирование
Глубокий анализ биоматериалов на уровне ДНК и РНК
Секвенирование miSeq и по Сэнгеру
Секвенирование микробиоты (16s)
Фрагментация ДНК и анализ длин
Амплификация и количественный анализ нуклеиновых кислот
Электрофорез, хроматография
Измерение концентрации биомолекул
Клеточная биология
Точное оборудование и защита качества на каждом этапе
Биобанк и CO₂-инкубатор Galaxy
Криохранилище и криостаты
Станции автоматического дозирования (Microlab STARlet, QIAgility)
Ламинарные боксы ЛБ-1К
Мельница ZM 200, система iScan, дозаторы и оборудование для пробоподготовки
Оборудование
Гомогенизатор Tissue Lyser II (QIAGEN) Гомогенизатор TissueLyser II предназначен для одновременной гомогенизации множества биологических образцов путем высокоскоростного встряхивания в пластиковых пробирках.
Ультразвуковая ванна SONOREX DIGITEC DT 52Н Мощная ультразвуковая ванна Bandelin DT 52H с цифровым управлением для быстрой дегазации.
Полногеномный NGS-секвенатор DNBSEQ-G50 (MGISEQ-200) Настольный полногеномный секвенатор нового поколения DNBSEQ-G50. Производительность: 500 млн прочтений за запуск.
Секвенатор MiSeq MiSeq — одна из самых универсальных NGS-систем в сегменте невысокой производительности.
Генетический анализатор 3500 Applied Biosystems Генетический анализатор 3500XL предназначен для секвенирования и фрагментного анализа.
Нанопоровый секвенатор MinION MinION — нанопоровый секвенатор производства компании Oxford Nanopore Technologies с максимальной производительностью до 30 млрд. нуклеотидов за один запуск и без ограничений по длине прочтений.
Станция дозирующая автоматическая Hamilton Microlab STARlet (8 каналов) Станция дозирующая автоматическая Microlab STARlet представляет собой универсальное компактное решение для автоматизации наиболее трудоемких, контаминационно-опасных и чувствительных к ошибкам оператора этапов ПЦР-исследований: выделение нуклеиновых кислот (НК), подготовка проб к ПЦР, пулирование образцов.
Исследовательский микроскоп Axio Observer A1
Микроскоп Leica DMi8
Рамановский конфокальный микроскоп
Центрифуга DM0412 с ротором 12−10P (12×10 мл)
Центрифуга лабораторная многофункциональная 5810R
Центрифуга для медицинских и биохимических лабораторий Heraeus Pico
Система дозирования жидкостей автоматическая прецизионная QIAgility
Система для генотипирования образцов биологического материала iScan
Проточный цитофлуориметр BD Accuri TM C6
Высокопроизводительный синтезатор ДНК/РНК ASM-2000 с высокопроизводительной установкой для очистки олигонуклеотидов OPS-1000
Уникальная научная установка «Опытный биоскрининговый комплекс» (УНУ ОБК МФТИ) включает в себя четыре участка: подготовительный, производственный, доклинического скрининга и молекулярно-генетического анализа, оснащенные как отечественным, так и импортным оборудованием.
На подготовительном участке проводят работы по очистке воздуха; подготовке и стерилизации посуды и оборудования; приготовлению и стерилизации сред для культивирования; поддержанию в коллекциях клеточных культур; подготовке отобранных линий к аппаратному выращиванию. Участок укомплектован набором дистилляторов и паровых автоклавов, моющим оборудованием, стерилизационными и сушильными установками, культуральными боксами с микроскопами, ламинарами, инкубаторами.
Производственный участок оснащен перфузионными ячейками и полноорганным биореактором, в которых осуществляют собственно аппаратное культивирование органоидов при одновременном мониторинге процессов роста, инвазии и клеточной экспрессии.
Участок доклинического скрининга на животной модели в установке скринингового наблюдения на зебраденио, оснащенной системами технического зрения для проведения физиологических тестов с параллельной оценкой метаболитов.
Участок молекулярно-генетического анализа, оснащенный приборами для проведения метаболомного, протеомного, геномного анализа, оснащенный оборудованием для проведения химического анализа. В состав входят спектрофотометры, конфокальные рамановские микроскопы, single cell sequencing, напонопровые секвенаторы и NGS секвенаторы